上海市医药学校药剂专业从1992年开始招生，是学校传统的优势专业，是示范校重点建设专业，也是上海市中职学校“品牌专业”。
本专业坚持立德树人、德技并修、学生全面发展，主要面向药品经营企业以及药品生产企业等企事业单位，培养具有一定的文化水平、良好的职业道德和人文素养，能在生产、服务第一线从事药品零售、药品营销、药品采购、药品验收、药品养护、药品保管及药品运输等岗位工作，具有职业生涯发展基础的知识型、发展型、高素质技术技能人才。
药剂专业在原有订单培养模式的条件下，逐步建立了“校企合作，全程嵌入＂的人才培养模式。由学校专职教师与医药行业专家能手共建教学团队，共同制定人才培养方案，共同授课，全方位提升教学质量，为上海医药行业培养了高素质的应用型技术人才。毕业生毕业时获取药剂专业毕业证书，并通过考试获得1种以上相关技能证书，可选择继续升学，也可在医药经营企业从事相关工作。药剂专业对口辐射云南地区，招收云南学生。
药剂专业需要完成《医学基础》、《药学基础》、《医药商品基础》、《GSP实务》、《药事管理与法规》、《中医药基础》、《医药市场营销》、《常见病用药指导》、《药品购销技术》、《药品调剂技术》、《医药仓储与配送》、《电子商务实用技术》、《药品储存与养护技术》等课程。
本专业拥有一批年龄、学历、职称等结构合理、素质优良、责任心强的教师团队，专业教师20名，兼职教师6名，高级职称45%，中级职称50%，初级5%；双师型100%；10人获得医药商品购销员（高级）证书，3人获得职业药师证书， 3人获得物流师一级证书，1人获得国家级医药商品购销员裁判员证书，2人获得国家级医药商品储运员裁判员证书。
本专业配备校内外实训基地。校内有医药商品购销实训基地，包括诊疗室、营销情景室、电子商务实训室、模拟药房、社区配药实训室等共212工位，另有医药现代物流实训中心。实训基地具有教育部“1+X”药品购销证书考核的功能。药剂专业目前与上海医药、国药物流、华氏药房等药品经营企业共建校企合作顶岗实习基地30家，提供药品经营、购销、质量控制等岗位供学生进行药品购销和仓储的实习，另有药品生产企业33家可以提供部分药品生产、物流和销售岗位的实习。
本专业毕业生的就业率及专业对口率较高，毕业学生能够遵守企业、社会的各项规范和职业要求，爱岗敬业，取得用人单位和企业一致好评。
